源自国外?新冠病毒溯源深陷迷雾

2020-08-02 19:27 admin

2月27日,国家卫健委高等级专家组组长钟南山在新闻通气会上标明,疫情首要出现在我国,纷歧定是发源在我国。

一起,最新研讨标明,继蛇、穿山甲、水貂之后,龟类也或许是新冠病毒的潜在中心宿主。

有关新冠病毒溯源的新进展连绵不断。但是,它从哪里来?怎么抵达人类?又为什么是武汉?这些问题迄今没有答案,病毒溯源依然深陷迷雾之中。

起点:翻开蝙蝠的 潘多拉魔盒

2019年12月31日,武汉卫健委发布公告证明,已发现27例与华南海鲜城有相关的病毒性肺炎病例。不久后,病原检测成果显现,这些病例源自一种不知道的 新式冠状病毒 。

病原体的确认,吹响了追寻 疑犯 的号角。最早被科学家追寻到的是病毒的起点 蝙蝠。2020年1月23日,中科院武汉病毒所石正丽团队在预印本网站BioRxiv在线宣告论文,指出蝙蝠是最有或许带着新冠病毒的野生动物。2月3日,该文在线宣告于《天然》杂志。

研讨团队发现,与此前在云南中菊头蝠上检测到的蝙蝠冠状病毒RaTG13相比较,新冠病毒在整个基因组中与其有96.2%的一致性,与SARS冠状病毒有79.5%的一致性。一起,新冠病毒经过与人体内广泛散布的蛋白ACE2结合进入细胞,与当年非典病毒的 套路 千篇一律。[1]

这为蝙蝠是新冠病毒的天然宿主供给了强有力的依据,得到了科学界广泛一致。

争议一起存在。新冠病毒能否直接从蝙蝠到人?1月31日,华盛顿大学生物信息学专家Trevor Bedford承受《科学》采访时指出: RaTG13序列与新冠病毒有近1100个核苷酸的差异。 根据此,专家们以为,这意味着它从蝙蝠到人之间还存在1个或多个中心宿主。

不过,据《榜首财经》2月24日报导,美国瓦克斯曼微生物研讨所所长Richard Ebright以为,从蝙蝠病毒到人感染的新式冠状病毒,或许不需求再有中心宿主。

石正丽团队2018年2月在Virologica Sinica上宣告的一项实证研讨也佐证了这一点。论文称,在对218名云南居民的采样查询中,有6人在SARS相关冠状病毒的检测中呈阳性。扫除其他或许要素后,这项研讨供给了蝙蝠SARS相关冠状病毒或许感染人类的首份血清学依据。[2]

翻开蝙蝠的 潘多拉魔盒 后,有没有中心宿主、又是谁扮演了中心宿主的人物?

中心宿主:薛定谔的穿山甲

继SARS冠状病毒和MERS冠状病毒之后,新冠病毒是几十年来人畜共患型冠状病毒第三次跨物种感染人类。曩昔两次经历标明,确认中心宿主并不简单。

从蛇、水貂到穿山甲、龟类,新冠病毒中心宿主好像 薛定谔的猫 。有关新冠病毒中心宿主的研讨中,穿山甲嫌疑最大。

2月7日,华南农业大学举行新闻发布会,宣告在穿山甲体内发现了 冠状病毒的序列,与现在感染人的毒株序列类似度高达99%,由此估测其是潜在中心宿主。[3]

研讨团队随后提交的预印本论文显现,在全基因组层次上,穿山甲冠状病毒全组基因与人新冠病毒的同源性为90%。[4]论文作者将这一差异解释为 生物信息学小组和研讨实验室之间令人为难的过错交流 。[5]

论文最令人振奋的定论是,在最为要害的刺突蛋白受体结合域上,穿山甲冠状病毒与新冠病毒仅有一个氨基酸不同。

来自学界的质疑则以为,穿山甲样本的来历至关重要。 现在尚不清楚宏基因组样品来自养殖场所仍是户外,假如1000份穿山甲样品仅来自一个特别的集体,则没有代表性。 中科院动物所研讨员蒋志刚对《我国科学报》标明。[7]

2月21日,香港大学教授管轶团队提交的预印本论文佐证了这一定论。他们在私运穿山甲安排样品中发现冠状病毒,受体结合域的氨基酸序列与人新冠病毒类似性高达97.4%。[6]

另一项研讨得到了天壤之别的定论。广东省生物资源运用研讨所教授陈金平团队剖析,尽管穿山甲冠状病毒与新冠病毒、蝙蝠冠状病毒都有遗传相关性,但咱们不清楚这种穿山甲带着冠状病毒的人畜共患状况,所以不能直接证明穿山甲便是新冠病毒的中心宿主。[8]

此前,陈金平团队曾在Viruses宣告论文,提醒了另一批私运的马来穿山甲被冠状病毒感染。[9]

美国贝勒医学院Joe Petrosino研讨团队则总结,在刺突蛋白的受体结合区域新冠病毒与穿山甲冠状病毒最像,在全基因组层面又与蝙蝠冠状病毒RaTG13最像。 这标明,新冠病毒的演化过程中,发作过不止一次的重组,穿山甲仅仅参加了其间的一环。 该团队2月13日在BioRxiv上宣告的论文中称。[10]

2月26日,湖北医学院隶属人民医院刘龙联课题组等在《医学病毒学杂志》上宣告的论文指出,选用冠状病毒刺突蛋白和宿主ACE2受体的组成和差异,猜测龟类也或许是新冠病毒传达给人类的潜在中心宿主。[11]

中山大学医学院院长郭德银告知《我国科学报》: 关于新冠病毒从天然界中的某种宿主到中心宿主再到人,科学尽管难以以一种重现的办法去证明,却可以用确凿的依据,以齐备的逻辑构成依据链,去确证成果。

进攻人类:海鲜商场疑云待解

新冠病毒从野生动物跨物种进军人类的过程中,发作了什么?又是在哪里发作的?

分子层面的微观生物学研讨是答复基础科学问题的重要办法。2月21日,西湖大学研讨人员运用冷冻电镜,发现新冠病毒刺突蛋白像一座桥横跨在ACE2外表,又像病毒的一只手紧紧抓住ACE2。[12]

一起,根据测序成果的一致是,病毒一次性进入人体,然后进行人际传达。

国内一位病毒学家告知《我国科学报》: 现在正在传达中的病毒来历于同一个 先人 ,传达途径或许是病毒从动物偶尔传染给某一个特定的人,发作了变异,然后开端人际传达。所以,假如能找到最早发作感染的 零号患者 ,病毒源头就找到了。

带着寻觅 零号患者 的使命,流行病学家参加进来。当然,对他们而言,更有意义的是 指示病例 ,指可以观察到的首个病例。

跟着前期病例连续宣布,查找方针锁定在华南海鲜商场。《我国新闻周刊》对武汉市中心医院急诊科主任艾芬的采访中说到,2019年12月18日该院接到首位病患为华南海鲜商场送货员。2019年12月27日, 疫情上报榜首人 张继先上报榜首批四位患者中,包括华南海鲜商场的一位商户。

另据我国疾控中心1月26日音讯,从华南海鲜商场的585份环境样本中,检测到33份样品含有新式冠状病毒核酸。[13]

不过,也有越来越多的依据显现,此前的估测或许错了。武汉金银潭医院副院长黄朝林等1月24日在《柳叶刀》宣告的论文显现,41个病例中只要27个病例有海鲜商场的露出史。特别是,2019年12月1日发病的首名患者没有海鲜商场露出史,12月10日发病的三人中有两人也与海鲜商场无关。[14]

2月26日, 武汉发布 微博发布,武汉市挂号陈述最早的新冠肺炎患者为陈某,发病时刻为2019年12月8日,否定去过华南海鲜商场。

海鲜商场只在前期疫情发挥了 火上加油 的效果。2月20日,我国科学院西双版纳热带植物园发布的研讨为这一定论供给了数据支撑。

这项研讨剖析了现有数据库中93个病毒样本中的58种单倍型,以了解不同病毒样本的演化联络。成果显现,与蝙蝠冠状病毒严密相关的 祖辈 ,和华南海鲜商场的 孙辈 没有亲缘联络。研讨人员据此揣度,华南海鲜商场的新冠病毒是从其它当地传入,再在商场发作快速传达并延伸。[15]

从蝙蝠到穿山甲,再到华南海鲜商场,新冠病毒源头和传达途径依然错综复杂,全部假定和揣度需求时刻和研讨工作去证明。

参考文献:

[1]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7

[2]https://www.virosin.org/en/article/doi/10.1007/s12250-018-0012-7

[3]https://www.scau.edu.cn/2020/0208/c1302a219376/page.htm

[4]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.17.951335v1

[5] https://mp.weixin.qq.com/s/NVdljRXbuoTZ0EzybOKVrA

[6]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1

[7] https://mp.weixin.qq.com/s/vrFcp_B6JWhFKSekXMd9IA

[8] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.18.954628v1

[9]https://www.mdpi.com/1999-4915/11/11/979

[10] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.939207v1

[11]https://mp.weixin.qq.com/s/xPVg871X8V9VCbKOBWTo-g

[12] https://www.westlake.edu.cn/info/1017/4353.htm

[13] ttp://www.chinacdc.cn/yw_9324/202001/t20200127_211469.html

[14]101508497.html

[15]https://mp.weixin.qq.com/s/eAsXMS13i7NGH-pXOt1Kaw

相关专题:聚集武汉新式冠状病毒肺炎疫情

为您推荐